播道會樂恩福音堂原身乃為播道會窩打老道山福音堂（簡稱窩福）的一個植堂，於1999年4月開始籌備，5月有異象分享，經過為期三個月的植堂訓練（7月至9月），在1999年9月5日正式開始第一次崇拜，當時主日崇拜的地點是租用位於九龍塘播道神學院之禮堂，教會的辦公室及小組聚會則在九龍塘森麻實道。
當年帶領植堂的溫清華牧師在《窩福家書》寫道（1999年3月）：「靠著三一神的恩典與幫助，在公元2000年開始一所新堂會，兼具下列數特點：
動力教會：(i)
以福音事工為使命和首務；(ii)
對大專生和大專畢業生有負擔；(iii)
承擔繼續植堂，作為未來發展目標。
健康教會：(i)
成為訓練和差派中心；(ii)
藉著小組彼此牧養建立；(iii)
服侍社群，回應世界需要。」
期後，樂恩堂於2000年4月1日正式自立成為播道會第49間堂會，同年7月遷入九龍塘聯合道322號華都大廈4樓作為堂址聚會，聚會人數不斷增加。
2008年，因應華都大廈被浸會醫院購入作日後重建用，在神的帶領下，教會覓得另一聚會地點，於5月中遷往大角咀深旺道3號嘉運大廈一樓商場103號，港鐵奧運站旁，同年6月1日舉行獻堂典禮，在此傳主福音，建立教會。
時至今日，教會已從對大專生事工的專注，發展成為服侍所有年階（兒童、青少年、大專、職青、家庭、長者）的教會，除拉闊的服侍對象以外，樂恩堂繼續傳承植堂以來的異象：廣傳福音，小組牧養，訓練差派，服侍社群，承擔主耶穌託付的大使命。願神繼續賜福祂自己的教會，興旺成熟，榮耀主名。